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43. Diversity Workbench Workshop am IT-Zentrum der SNSB (ZOOM online event)#

Thema: Schlaglichter rund um das Diversity Workbench Netzwerk

Mit diesem Workshop wollen wir ein paar wenige Datenmanagement-Themen von allgemeinem Interesse ansprechen. Dies soll anhand von Kurzvorträgen, Software-Demos (max. 10 min) und folgenden kurzen Diskussionsbeiträgen (max. 5 min) geschehen.

An der Organisation beteiligt #

• aus München: Dagmar Triebel, Ariane Grunz, Anton Link, Dieter Neubacher, Wolfgang Reichert, Stefan Seifert, Tanja Weibulat, Markus Weiss

• aus dem NFDI4Biodiversity Konsortium: Sven Bingert (GWDG), Peter Grobe, Birgit Klasen (ZFMK/LIB), Joachim Holstein (SMNS) sowie D. Triebel, A. Grunz, S. Seifert, T. Weibulat

• aus Bayreuth, Universität Bayreuth: Janno Harjes, Gerhard Rambold

• aus dem Nationalpark Schwarzwald: Christoph Dreiser

• aus RWTH Aachen: Alexander Bach

Um das Programm besser nach Erfahrungshintergrund und Interessenlage der einzelnen Teilnehmer*innen ausrichten zu können, bitten wir um Anmeldung direkt bei Tanja Weibulat. Die Teilnehmerzahl ist auf 25 Personen begrenzt.

Agenda, Vorträge#

22. Juni 2022

• 10.00 Uhr Begrüßung (D. Triebel, T. Weibulat)
• 10.15 Uhr Grundidee und Zielgruppen der DWB (D. Triebel)
• 10.30 Uhr Identifizieren von Organismen nach Merkmalen? Im Zeitalter von KI? (A. Grunz)
• 10.45 Uhr Schädlingsüberwachung in Sammlungsräumen - Sensoren und digitale Dokumentation (Integrated Pest Management, IPM) (M. Weiss)
• 11.00 Uhr Die Welt der Schubladen und Kästen mit Sammlungsobjekten - Information zu Objektgruppen (Kastendigitalisierung) (M. Weiss)
• 11.15 Uhr DWB auf dem Weg: Taxonomische Interoperabilität und Autonomie (D. Triebel)
• 11.30 Uhr DWB Training - ohne Installation? (S. Bingert)
• 11.45 Uhr Verbreitung und Verbreitungsmuster in Raum und Zeit - ein einzelner Punkt unter Millionen (S. Seifert)
• 12.00 Uhr Mittagspause
• 13.00 Uhr Meine Daten wirklich freigeben? Wer und wann? Und wie? Georeferenzierte Daten freigeben über verschiedene Forschungsportale (T. Weibulat)
• 13.15 Uhr Wie hängt das eine mit dem anderen zusammen? Forschungsdesign, FAIRe Daten und strukturierte Analyse (J. Harjes)
• 13.30 Uhr Möglichkeiten der automatisierten, ökologischen Auswertung großer Datenbestände aus DWB heraus am Beispiel der Webspinnen (A. Bach)
• 13.45 Uhr SMNS Schlagworte und Kataloge - Jeder für sich? - wie ordnen wir Information (J. Holstein)
• 14.00 Uhr Die Rolle von DWB in der Daten- und Sammlungsinfrastruktur des LIB/ZFMK (B. Klasen)
• 14.15 Uhr DWB am Nationalpark Schwarzwald (C. Dreiser)
• 14.30 Uhr Datenmanagementpläne in DiversityDescriptions - eine erste Analyse zur Service-Übergabe von GFBio an NFDI4Biodiversity (T. Weibulat)
• 14.45 Uhr Diskussionsrunde

Diversity Workbench Entwickler Plattform#

• DWB Support und training materials
• Diversity Workbench Information Models
• Diversity Workbench Software
• DiversityNaviKey Progressive Web App
• DiversityMobile App on Windows Phone Store
• Empfehlungen für Software-Entwickler
• DWB User Manuals with DWB Video Tutorials in German

Diversity Workbench – empfohlen von der DFG und GFBio#

DFG RISources mit Diversity Workbench – Text DE

GFBio recommended research data management mit DWB in 10 questions

GFBio guided research data submission mit DWB

Dienste des SNSB IT Center in seiner Rolle als GFBio Datenzentrum, GBIF Data Publisher und CETAF Data Provider#

• Archivierung and Publikation von Bio- und Geodiversitätsforschungsdaten, siehe Portfolios der GFBio Data Centers und Profile des Data Center SNSB

• DWB BioCASe Data pipelines und RDF services with overview on occurrence datasets published via SNSB

Virtuelle Forschungsumgebungen und DWB Netzwerke, DiversityNaviKey, DiversityMobile#

• DWB Netzwerk an den SNSB

• MOD-CO Projekt mit MOD-CO Schema und Use Cases für das MOD-CO Schema (im Aufbau)

• DiversityNaviKey Datenbestände zur interaktiven Identifikation und Diagnose

• DiversityMobile – Smartphone App (WindowsPhone) als Teil einer Forschungsumgebung (IBF)

• Flora von Bayern
  • aus DWB Daten dynamisch erzeugte Verbreitungskarten für in Bayern vorkommende Farn- und Blütenpflanzen
  • DWB Datenfluss Grafiken (Version 2015)
  • DiversityMobile im Einsatz
  • DWB Tabellen-Editor für TK25 Rasterdaten und Bayernflora-Editor im Einsatz
  • DiversityGISeditor im Einsatz
  • DiversityTaxonNames im Einsatz

• Regionalised and Domain-specific Taxon Lists

GBOL Data Transfer Applications#

• Lims2Fims und Lims2Fims documentation

• sync gbol data und sync gbol data documentation

Literatur zum Workshop#

Harjes, J., Link, A., Weibulat, T., Triebel, D. & Rambold, G. 2020. FAIR digital objects in environmental and life sciences should comprise workflow operation design data and method information for repeatability of study setups and reproducibility of results, Database, 2020 (Article ID baaa059), 1–20. – DOI:10.1093/database/baaa059

Mulligan, Connie J.; Boyer, Doug M.; Turner, Trudy R.; Delson, Eric & Leonard, William R. (2022). Data sharing in biological anthropology. American Journal of Biological Anthropology. – DOI:10.1002/ajpa.24499

Triebel, D., Grunz, A., Seifert, S., Link, A. & Rambold, G., (2021). DiversityNaviKey, a Progressive Web Application for interactive diagnosis and identification. In: , . (Hrsg.), INFORMATIK 2021. Gesellschaft für Informatik, Bonn. (S. 517-538). – DOI: 10.18420/informatik2021-040

Triebel, D., Reichert, W., Bosert, S., Feulner, M., Osieko Okach, D., Slimani, A. & Rambold, G. 2018. A generic workflow for effective sampling of environmental vouchers with UUID assignment and image processing. – Database, 2018 (Article ID bax096), 1–10. – https://doi.org/10.1093/database/bax096

Ausführliche und aktuelle Literaturlisten, jeweils mit Fokus auf dem thematischen Schwerpunkt des Workshops, finden sich auf den Websites der online Veranstaltungrn 2020 bis 2021 (siehe Archiv).