DivWorkbenchWorkshop_40

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40. Diversity Workbench Workshop am IT-Zentrum der SNSB#

Thema: Einführung in die Diversity Workbench; Schwerpunkt: Management von Sammlungsdaten, taxonomischen Daten und Terminologien, DWB als Teil des GFBio Netzwerkes

Es wird das Management von Daten im Bereich Bio- und Geodiversitätsforschung mit direktem Sammlungsbezug behandelt. Dies betrifft Daten zur Sammlungsobjektverwaltung, Verwaltung von Sammlungstransaktionen, wie auch das Management von Taxonomien, Terminologien und Geoobjekten. Dabei werden Fragen der Interoperabiliät, des Datenaustauschs und der Standardisierung behandelt, auch mit Bezug zur German Federation for Biological Data (GFBio). Die Teilnehmer werden angeleitet, mit den DWB-Applikationen DiversityAgents, DiversityCollection, DiversityScientificTerms, DiversityTaxonNames sowie dem DWB GIS Editor in einer Trainingsdatenbank selbständig zu arbeiten. Verschiedene Vorträge und Demos verdeutlichen den vielfältigen und flexiblen Einsatz der Software.

An der Vorbereitung und Durchführung des Workshops beteiligtes Team

Der Workshop wird in Kooperation mit der German Federation for Biological Data (GFBio) veranstaltet.

Organisatorisches und Technisches#

Arbeitsprogramm#

1. Dezember 2020

2. Dezember 2020

Teilnehmer Institut Fachgebiet
Rosa Albrecht Zoologische Staatssammlung München, SNSB Zoologie, GBOL III
Alexandros Avlastimidis Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns Informatik
Nora Battermann Staatssammlung für Anthropologie und Paläoanatomie, SNSB Sammlungsmanagement Paläoanatomie
Katharina Bohley Botanischer Garten München-Nymphenburg, SNSB Botanik
Herbert Boyle Senckenberg Museum für Naturkunde Görlitz Mykologie
Caroline Chimeno Zoologische Staatssammlung München, SNSB Zoologie, GBOL III
Ulrike Damm Senckenberg Museum für Naturkunde Görlitz Mykologie
Wolfgang Diewald Botanische Staatssammlung München, SNSB und SNSB IT Center Botanik, Flora des Böhmerwaldes
Martin Ebert Jura-Museum Eichstätt, SNSB Paläontologie
Chris Erhardt Zoologisches Forschungsmuseum Alexander Koenig, ZFMK Zoologie
Hans-Joachim Esser Botanische Staatssammlung München, SNSB Botanik
Michaela Grein Übersee-Museum Bremen Botanik
Andrea Grigat Staatssammlung für Anthropologie und Paläoanatomie, SNSB Sammlungsmanagement Anthropologie
Peter Grobe Zoologisches Forschungsmuseum Alexander Koenig, ZFMK Zoologie, GFBio
Selin Gürkan Botanische Staatssammlung München, SNSB und SNSB IT Center Botanik, Flora von Bayern
Imelda Hausmann Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie, SNSB Paläontologie
Patricia Hein Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie, SNSB Paläontologie
Felix Hentschel Mineralogische Staatssammlung München, SNSB Sammlungsmanagement Mineralogie
Hubert Höfer Staatliches Museum für Naturkunde, Karlsruhe Zoologie
Joachim Holstein Staatliches Museum für Naturkunde, Stuttgart Zoologie
Christina Ifrim Jura-Museum Eichstätt, SNSB Paläontologie
Malte Junge Mineralogische Staatssammlung München, SNSB Mineralogie
Melanie Kaliwoda Mineralogische Staatssammlung München, SNSB Mineralogie
Gudrun Kirchhof Botanische Staatssammlung München, SNSB Mykologie
Sophie Klare Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie, SNSB Sammlungsmanagement Paläontologie
Birgit Klasen Zoologisches Forschungsmuseum Alexander Koenig, ZFMK Zoologie, GFBio
Michael Krings Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie, SNSB Paläontologie (Paläobotanik)
Henrik Kusche Centrum für Naturkunde (CeNak), Universität Hamburg Sammlungsmanagement, Digitalisierung
Volker Lohrmann Übersee-Museum Bremen Entomologie
Damaris Margaritis Nationalpark Schwarzwald Ökologisches Monitoring und Artenschutz
Juan-Carlos Monje Staatliches Museum für Naturkunde, Stuttgart Zoologie, GFBio
Ulrike Najmi Universitätsrechenzentrum (URZ), Universität Greifswald Informatik
Eva-Maria Natzer Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns Wissenschaftliche Geschäftsführung
Martin Nose Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie, SNSB Paläontologie
Carla Novoa Sepúlveda Botanische Staatssammlung München, SNSB Sammlungsmanagement Botanik und Mykologie
Alexander Nützel Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie, SNSB Paläontologie
Björn Quast Zoologisches Forschungsmuseum Alexander Koenig, ZFMK Zoologie
Mike Reich Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie, SNSB Paläontologie
Karl-Heinz Rexer Herbarium Marburgense, Universität Marburg Evolutionäre Ökologie der Pflanzen
Vanessa Roden Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns Sammlungsassessment, Paläontologie
Gertrud Rößner Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie, SNSB Paläontologie (fossile Säugetiere)
Aliaksandra Rost Mineralogische Staatssammlung München, SNSB Mineralogie
Michaela Schwager Senckenberg Museum für Naturkunde Görlitz Mykologie
Camila Uribe-Holguin Botanische Staatssammlung München, SNSB und Ludwig-Maximilians-Universität München Botanik
Peter Warth Staatliches Museum für Naturkunde, Stuttgart Zoologie
Wiebke Walbaum Staatliches Museum für Naturkunde, Stuttgart Biodiversitätsinformatik
Julia Wellsow Botanische Staatssammlung München, SNSB und SNSB IT Center Botanik, Flora von Bayern

Weitere Information#

Zugangsdaten zu den DWB Trainingsdatenbanken (nach dem Workshop)#

Diversity Workbench Entwickler Plattform#

Diversity Workbench – empfohlen von der DFG und GFBio#

Dienste des SNSB IT Center in seiner Rolle als GFBio Datenzentrum, GBIF Data Publisher und CETAF Data Provider#

Virtuelle Umgebungen zum Sammlungsmanagement#

Virtuelle Forschungsumgebungen und DWB Netzwerke, Diversity Mobile#

GBOL Data Transfer Applications#

Literaturempfehlung allgemein#

DiSSCo Knowledge Base Dokumente

FAIR Principles Special Issue 2019: 1–296.

DiSSCo Digital Specimen Concept Diagram (Lannom et al. 2020, Figure 2) for download, see here

DiSSCo Tech: Natural Science Identifiers and CETAF Stable Identifiers

Minimum Information about a Digital Specimen (MIDS): here

GeoCASe – Geosciences Collection Access Service with ABCDEF XML Schema

Borsch T, Stevens A-D, Häffner E, Güntsch A, Berendsohn WG, Appelhans MS, Barilaro C, Beszteri B, Blattner FR, Bossdorf O, Dalitz H, Dressler S, Duque-Thüs R, Esser H-J, Franzke A, Goetze D, Grein M, Grünert U, Hellwig F, Hentschel J, Hörandl E, Janßen T, Jürgens N, Kadereit G, Karisch T, Koch MA, Müller F, Müller J, Ober D, Porembski S, Poschlod P, Printzen C, Röser M, Sack P, Schlüter P, Schmidt M, Schnittler M, Scholler M, Schultz M, Seeber E, Simmel J, Stiller M, Thiv M, Thüs H, Tkach N, Triebel D, Warnke U, Weibulat T, Wesche K, Yurkov A, Zizka G 2020. A complete digitization of German herbaria is possible, sensible and should be started now. – Research Ideas and Outcomes 6: e50675. doi.org/10.3897/rio.6.e50675

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Güntsch, A., Hyam, R., Hagedorn, G., Chagnoux, S., Röpert, D., Casino A., Droege, G., Glöckler, F., Gödderz, K., Groom, Q., Hoffmann, J., Holleman, A., Kempa, M., Koivula, H., Marhold, K., Nicolson, N., Smith, V. S. & Triebel, D. 2017. Actionable, long-term stable and semantic web compatible identifiers for access to biological collection objects. – Database, 2017, 1–9. https://doi.org/10.1093/database/bax003 doi.org/10.1093/database/bax003.

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