34. Diversity Workbench Workshop am IT-Zentrum der SNSB
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Thema: DWB Werkzeuge für ökologisch arbeitende Forschungsgruppen und -projekte
- Verwaltung von forschungsprojekt- und datensammlungs-bezogenen (Meta-)Daten mit DiversityProjects, Integration in GFBio Daten-Pipelines
- Projektarbeit und Datenerhebung im Gelände, verschiedene Workflows, a) mit DiversityImageInspector, b) mit DiversityMobile
- Projektarbeit und Management von ökologischen Traitdaten und phylogenetischen Merkmalsdaten mit DiversityDescriptions
- Projektarbeit und Datenmanagement im Labor mit DiversityDescriptions
- DiversityDescriptions als Werkzeug zur Entwicklung und Verwaltung von komplex strukturierten Konzept-Schemata
Im Workshop werden Szenarien mit Bezug zu GFBio, MOD-CO
und ARAMOB
adressiert.
An der Organisation und Durchführung des Workshops beteiligtes Team
- aus München: Dagmar Triebel
, Anton Link
, Wolfgang Reichert
, Tanja Weibulat
, Markus Weiss
- aus Bayreuth, UBT, Abt. Mykologie: Janno Harjes
, Daniel Osieko Okach
- aus Karlsruhe, Museum für Naturkunde Florian Raub
- aus Stuttgart, Museum für Naturkunde, Abt. Entomologie Ingo Wendt
Anmerkung: Interessenten an der DWB-Datenbank DiversityCollection und anderen DWB Applikationen wie DiversityTaxonNames und DiversityGisEditor können sich für einen nächsten Workshop, Mitte 2018, anmelden.
Organisatorisches#
- Ansprechpartner (Anreise etc.): W. Reichert
- Ort: Botanische Staatssammlung München
, Menzinger Str. 67, 1. Stock, Zi 138
- Anreise
- vom Flughafen München (Gesamtdauer ca. 60 min): Von der S-Bahn-Endhaltestelle am Flughafen mit der S-Bahn (S 1) Richtung Hauptbahnhof. Die S-Bahn fährt alle 20 min. Aussteigen an der Haltestelle Moosach. Die Haltestellen zeigt die Übersicht des Schnellbahnnetzes
. Ab Bahnhof Moosach mit der Buslinie 51 Richtung Aidenbachstraße. Der Bus fährt alle 10 min. Haltestelle ist Maria-Ward-Straße. Von hier aus sind es 400 m zu Fuß entlang der Menzingerstraße stadtauswärts, wahlweise kann auch noch die Tramlinie 17 (Richtung Amalienburgstraße) für eine Haltestelle benutzt werden. Details zeigt das Innenraumnetz München
und die MVV Fahrplanauskunft
.
- vom Hauptbahnhof München (Gesamtdauer ca. 20 min): Ab Hauptbahnhof Nord mit der Trambahnlinie 17 Richtung Amalienburgstraße. Die Tram fährt alle 10 min. Haltestelle ist der Botanische Garten München-Nymphenburg. Details zeigt das Innenraumnetz München
und die MVV Fahrplanauskunft
.
- vom Flughafen München (Gesamtdauer ca. 60 min): Von der S-Bahn-Endhaltestelle am Flughafen mit der S-Bahn (S 1) Richtung Hauptbahnhof. Die S-Bahn fährt alle 20 min. Aussteigen an der Haltestelle Moosach. Die Haltestellen zeigt die Übersicht des Schnellbahnnetzes
- Zeit: 26.04.2018, Beginn: 10.00 Uhr, Ende: ca. 17.00 Uhr
- Mittagspause: ca. 12.30 Uhr bis 13.15 Uhr
- Kaffeepause: ca. 15.00 Uhr bis 15.30 Uhr
- Hardware: eigener Laptop (ab MS Windows XP; .Net Framework 3.5 wird ggf. vor Ort installiert)
(um einen Unkostenbeitrag von € 15 wird gebeten)
Arbeitsprogramm#
Thema ist das Management von Daten mit DWB Werkzeugen für ökologisch arbeitende Forschungsgruppen und -projekte. Dabei werden auch Fragen der Interoperabiliät und des Datenaustauschs behandelt. Die Teilnehmer werden angeleitet, mit den DWB-Applikationen in Trainingsdatenbanken selbständig zu arbeiten. Neben dem Arbeiten am Laptop wird auch die Dateneingabe über ein Smartphone mit der DiversityMobile-App demonstriert.
- 10.00 Uhr Diversity Workbench – Einführung
(D. Triebel)
- 10.30 Uhr Einführung in und Arbeiten mit DiversityProjects (=DP), Verwaltung von forschungsprojekt- und datensammlungs-bezogenen (Meta-)Daten; Vorbereitung von Datenpaketen (mit (Meta-)Daten aus DiversityProjects, DiversityCollection und anderen DWB-Modulen) für die Integration in GFBio Pipelines zur Datenpublikation (T. Weibulat, M. Weiss)
- 11.30 Uhr Vorstellung von ''DiversityImageInspector''
(W. Reichert, D. Osieko Okach)
- 12.00 Uhr Möglichkeiten mobiler Datenerfassung mit der DWB
, mit Schwerpunkt auf DiversityMobile (T. Weibulat)
- 12.30 Uhr Mittagspause
- 13.15 Uhr DiversityDescriptions: Einführung (A. Link)
- Konzept und Grundfunktionen
- Demo von Import- und Export-Möglichkeiten
- Beispiele aus Trainingsumgebung
- 14.30 Uhr ''DiversityDescriptions'': Projektarbeit und Management von ökologischen Traitdaten, Interaktion mit anderen DWB-Modulen
(F. Raub)
- 15.00 Uhr Kaffeepause
- 15.30 Uhr DiversityDescriptions: Projektarbeit und Management von phylogenetischen Merkmalsdaten, Artbeschreibungen, interaktive Schlüssel, Publikationen (I. Wendt)
- 16.00 Uhr ''DiversityDescriptions'': Werkzeug zur Entwicklung und Verwaltung von komplex strukturierten Konzept-Schemata
(J. Harjes, A. Link)
- 16.25 Uhr ''DiversityDescriptions'': Projektarbeit und Datenmanagement im Labor
(J. Harjes, A. Link)
- 16.45 Uhr Diskussion
- 17.00 Uhr Ende
Teilnehmer | Institut | Fachgebiet |
---|---|---|
Sönke Birk | Nationalpark Schwarzwald Freudenstadt | Geodatenmanagement |
Wolfgang Diewald | Botanische Staatssammlung München und SNSB IT Center | Botanik |
Christoph Dreiser | Nationalpark Schwarzwald Freudenstadt | Umweltmonitoring und Geodatenmanagement |
Asli Ekizoglu | Ruhr-Universität Bochum | Geobotanik |
Janno Harjes | Universität Bayreuth | Mykologie |
Hubert Höfer | Staatliches Museum für Naturkunde Karlsruhe | Zoologie |
Martin Kemler | Ruhr-Universität Bochum | Geobotanik |
Daniel Osieko Okach | Universität Bayreuth | Pflanzenökologie |
Anke Penzlin | Senckenberg Gesellschaft für Naturforschung Frankfurt | Biodiversitätsinformatik |
Silke Petri | Nationalpark Schwarzwald Freudenstadt | Informatik |
Florian Raub | Staatliches Museum für Naturkunde Karlsruhe | Zoologie |
Tanja Rollnik | Ruhr-Universität Bochum | Geobotanik |
Carolin Schieren | Ruhr-Universität Bochum | Geobotanik |
Moritz Schröder | Ruhr-Universität Bochum | Geobotanik |
Karthik Shanmugam | Universität Bayreuth | Mykologie |
Ingo Wendt | Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart | Zoologie |
Diversity Workbench Entwickler Plattform#
- Training materials
- Diversity Workbench Information Models
- Diversity Workbench Software
- DiversityMobile App on Windows Phone Store
- Empfehlungen für Software-Entwickler
- DWB User Manuals
Zugangsdaten zu den DWB Trainingsdatenbanken#
- IP-Adresse: training.diversityworkbench.de
- Port: 5432
- SQL-Server authentification
- User: WORKSHOP
- Password: available on request
Diversity Workbench – empfohlen von DFG und GFBio#
DFG RISources mit Diversity Workbench – Text DE
GFBio recommended research data management und GFBio guided research data submission
mit Diversity Workbench
Dienste des SNSB IT Center in seiner Rolle als GFBio Datenzentrum#
- Archivierung and Publikation von Bio- und Geodiversitätsforschungsdaten, siehe Portfolios der GFBio Data Centers
und Profile des Data Center SNSB
Virtuelle Forschungsumgebungen und DWB Netzwerke, Diversity Mobile#
- DiversityMobile
– Smartphone App (WindowsPhone) als Teil einer Forschungsumgebung (IBF
)
- Flora von Bayern
- aus DWB Daten dynamisch erzeugte Verbreitungskarten für in Bayern vorkommende Farn- und Blütenpflanzen
- DWB Datenfluss Grafiken
(Version 2015)
- DiversityMobile im Einsatz
- DiversityGISeditor im Einsatz
- aus DWB Daten dynamisch erzeugte Verbreitungskarten für in Bayern vorkommende Farn- und Blütenpflanzen
GBOL Data Transfer Applications#
Literatur zum Workshop#
ARPHA Writing tool under https://arpha.pensoft.net/ and http://arphahub.com/
; import of species descriptions via XML/API?
Dallmeier-Tiessen, S., Khodiyar, V., Murphy, F., Nurnberger, A., Raymond, L. &Whyte, A. (2017). Connecting Data Publication to the Research Workflow: A Preliminary Analysis, International Journal of Digital Curation (IJDC), Vol 12, No 1, 2017, doi.org/10.2218/ijdc.v12i1.533
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