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Achtzehnter DiversityWorkbench Workshop am IT Zentrum der SNSBContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png #

Team am SNSB IT-Zentrum: D. TriebelContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png, M. WeissContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png, D. NeubacherContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png, W. ReichertContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png, T. WeibulatContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png, M. KnickContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png, A. LinkContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

Organisatorisches #

• Ansprechpartner (Anreise etc.): I. SebekContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png, T. WeibulatContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

• Ort: Botanische Staatssammlung MünchenContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png, Menzinger Str. 67, 1. Stock, Zi 139

• Anreise
  • vom Flughafen München (Gesamtdauer ca. 60 min): Von der S-Bahn-Endhaltestelle am Flughafen mit der S-Bahn (S 1) Richtung Hauptbahnhof. Die S-Bahn fährt alle 20 min. Aussteigen an der Haltestelle Moosach. Die Haltestellen zeigt die Übersicht des SchnellbahnnetzesContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png. Ab Bahnhof Moosach mit der Buslinie 51 Richtung Aidenbachstraße. Der Bus fährt alle 10 min. Haltestelle ist Maria-Ward-Straße. Von hier aus sind es 400 m zu Fuß entlang der Menzingerstraße stadtauswärts, wahlweise kann auch noch die Tramlinie 17 (Richtung Amalienburgstraße) für eine Haltestelle benutzt werden. Details zeigt das Innenraumnetz MünchenContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png und die MVV FahrplanauskunftContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png.
  • vom Hauptbahnhof München (Gesamtdauer ca. 20 min): Ab Hauptbahnhof Nord mit der Trambahnlinie 17 Richtung Amalienburgstraße. Die Tram fährt alle 10 min. Haltestelle ist der Botanische Garten München-Nymphenburg. Details zeigt das Innenraumnetz MünchenContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png und die MVV FahrplanauskunftContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png.

• Zeit: 30.01.2013, Beginn: 10.00 Uhr, Ende: ca. 17.00 Uhr
• Mittagspause: ca. 12.00 Uhr bis 13.00 Uhr
• Kaffeepause: ca. 14.45 Uhr bis 15.00 Uhr
• Hardware: eigener Laptop (ab MS Windows XP; .Net Framework 3.5 wird ggf. vor Ort installiert)

Arbeitsprogramm#

Thema ist das Management von Daten im Bereich Sammlungsverwaltung, Biodiversitätsforschung und Georeferenzierung. Die verschiedenen Typen von Interaktionen der in diesem Kontext zentralen Komponente DiversityCollection (=DC) mit anderen Komponenten der Diversity Workbench (=DWB) werden vorgeführt. Die Teilnehmer werden angeleitet, mit den DWB-Applikationen in Trainingsdatenbanken selbständig zu arbeiten. Neben dem Arbeiten an PC und Laptop wird auch die Dateneingabe über Smartphone "DiversityMobile" demonstriert.

• 10.00 Uhr Einrichtung der Accounts
• 10.15 Uhr Diversity Workbench – Systemdesign, Datenflüsse, Netzwerke und DiensteContent unavailable! (broken link)(info) (D. Triebel)
• 10.45 Uhr Einführung in "DiversityCollection" mit DC-Import-Wizard anhand des DC-Manuals (pdfContent unavailable! (broken link)(info), chmContent unavailable! (broken link)(info)) und kurze Vorstellung des Moduls "DiversitySamplingPlots"; Arbeiten mit DWB-Trainingsdatenbanken (M. Weiss)
• 11.45 Uhr Kurze Vorstellung der Möglichkeiten mobiler DatenerfassungContent unavailable! (broken link)(info) mit der DWB, mit Schwerpunkt auf "DiversityMobile"(T. Weibulat)
• 12.00 Uhr Mittagspause
• 13.00 Uhr Demo von "DiversityMobile" (Smartphones) im Botanischen Garten (J. Simmel, T. Weibulat)
• 13.30 Uhr Vorstellung von "DiversityGISeditor" und "DiversityGazetteer" (W. Reichert)
• 14.15 Uhr DiversityDescriptions: DD 2.0 – DD 3.0Content unavailable! (broken link)(info) mit Software-Demonstration DD 3.0 (D. Triebel, A. Link)
• 14.45 Uhr Kaffeepause
• 15.00 Uhr Einführung in "DiversityTaxonNames", "DiversityReferences", "DiversityProjects", "DiversityAgents" und "DiversityScientificTerms"; Arbeiten mit DWB-Trainingsdatenbanken (M. Weiss)
• 16.30 Uhr Diskussion

Diversity Workbench Entwickler Plattform#

• Diversity Workbench Information ModelsContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png
• Diversity Workbench SoftwareContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

Zugangsdaten zur DWB Trainingsdatenbank#

• IP-Adresse: training.diversityworkbench.de
• Port: 5432
• SQL-Server authentification
  • User: Training
  • Password: available on request
• Restrict to DiversityCollection...

Virtuelle Forschungsumgebung und Diversity Mobile#

• Workflow IBFContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

• DiversityMobileContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png on Smartphones with WindowsPhone

Daten in DiversityCollection online#

• via GBIF Portal SNSB GBIF Data PublisherContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png
• 27 BioCase-Wrapper DiensteContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png am SNSB IT-Zentrum
• 10 Webschnittstellen mit Zugriff auf Daten via DiversityCollectionCache

Daten in DiversityTaxonNames online#

• via Catalogue of Life/ Annual/Dynamic Checklist PortalContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png: Source databases "GSDs" LIASContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png und MELnetContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

• 2 Webschnittstellen und SOAP webservices mit Zugriff auf DTN Datenbanken:
  • LIAS namesContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png
  • Melastomataceae.NetContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

Literatur zum Workshop#

Chapman, A. D. 2005. Principles and Methods of Data Cleaning – Primary Species and Species-Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 72 pp. downloadContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

Chapman, A. D. 2005. Principles of Data Quality. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 58 pp. downloadContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

Chapman, A. D. 2005. Uses of Primary Species-Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 106 pp. downloadContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

Chapman, A. D. & Grafton, O. 2008. Guide to Best Practices for Generalising Sensitive Species Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 21 pp. downloadContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

Chapman, A. D. & Wieczorek, J. 2006 (eds.). Biogeomancer, Guide to Best Practices in Georeferencing. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 80 pp. downloadContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

Frazier, C. K., Wall, J. & Grant, S. 2008. Initiating a Natural History Collection Digitisation Project, version 1.0. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 75 pp. downloadContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

Gray, J., Liu, D. T., Nieto-Santisteban, M., Szalay, A. S., DeWitt, D. & Heber, G. 2005. Scientific Data Management in the Coming Decade. – Technical Report MSR-TR-2005-10. – 8 pp. downloadContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

Jablonski, S., Kehl, A., Neubacher, D., Poschlod, P., Rambold, G., Schneider, T., Triebel, D., Volz, B. & Weiss, M. 2009. DiversityMobile – Mobile data retrieval platform for biodiversity research projects. – In Fischer, S., Maehle, E. & Reischuk, R. (eds.), Informatik 2009 – Im Focus das Leben. Beiträge der 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e. V. (GI). GI-Edition: Lecture Notes in Informatics (LNI) - Proceedings 154: 27, 610–624. downloadContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

Triebel, D. 2009. Pilzherbarien – Neue Aufgaben im Bereich Biodiversitätsinformatik und Datenmanagement. – In Anonymous (ed.), Rundgespräche der Kommission für Ökologie, herausgegeben von der Bayerischen Akademie der Wissenschaften, Band 37: Ökologische Rolle von Pilzen. – 131–145. München. downloadContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

New! Triebel, D., Hagedorn, G. & Rambold, G. 2012. An appraisal of megascience platforms for biodiversity information. – MycoKeys 5: 45–63. – doi:10.3897/mycokeys.5.4302Content unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

Triebel, D., Neubacher, D., Weiss, M., Heindl-Tenhunen, B., Nash. T. H. III & Rambold, G. 2010. Integrated biodiversity data networks for lichenology – data flows and challenges. – In Nash, T.H. III, Geiser, L., McCune, B., Triebel, D., Tomescu, A.M.F. & Sanders, W.B. (eds.), Biology of lichens – symbiosis, ecology, environmental monitoring, systematics and cyber applications. – Biblioth. Lichenol. 105: 47–56.

Wieczorek, J., Guo, Q. & HiJmans, R. J. 2004. The point-radius method for georeferencing locality descriptions and calculating associated uncertainty. Int. J. Geographical Information Science 18(8): 747–767 downloadContent unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png

Papers on "Mass digitization of natural history collections"Content unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png#

Papers on a GBIF-supported "Data publishing framework for primary biodiversity data"Content unavailable! (broken link)http://snsb.info/SNSBInfoOpenWiki/images/out.png #