44. Diversity Workbench Workshop am IT-Zentrum der SNSB
(ZOOM online event)#
Thema: Management von Daten zu Personen und Organisationen in DWB Netzwerken ausgehend von DiversityAgents
Mit diesem Workshop wollen wir das Management von Daten zu Personen, Personengruppen und Organisationen ansprechen. Dies soll anhand von Kurzvorträgen zu laufenden Projekten, Software-Demos (jeweils 5-10 min) und folgenden kurzen Diskussionen (jeweils max. 5 min) geschehen.
An der Organisation beteiligt#
- aus München, SNSB IT-Zentrum, SNSB-BSM und LMU: Dagmar Triebel, Anton Link, Dieter Neubacher, Wolfgang Reichert, Stefan Seifert, Tanja Weibulat, Markus Weiss, Andreas Beck, Ingrid Sebek, Carla Novoa Sepúlveda, Camila Uribe
- aus dem NFDI4Biodiversity Konsortium: Sven Bingert (GWDG), Birgit Klasen (ZFMK/LIB), Joachim Holstein (SMNS), Peter Grobe (ZFMK/LIB), Juan Carlos Monje (SMNS), Stefan Seifert, Dagmar Triebel, Tanja Weibulat
- aus der Flora von Bayern Initiative mit Koordinationsstelle Bayernflora: Ingo Wendt, Birgit Klasen
- aus dem Projekt FörTax – Förderung von taxonomischem Wissen als Grundlage für den Naturschutz: Nicole Nöske, Christian Bräunig
Um das Programm besser nach Erfahrungshintergrund und Interessenlage der einzelnen Teilnehmer*innen ausrichten zu können, bitten wir um Anmeldung direkt bei Tanja Weibulat.
Agenda, Vorträge und Demos#
2. August 2023
- 10.00 Uhr Begrüßung und Einführung
(T. Weibulat, D. Triebel)
- 10.15 Uhr Grundidee und Zielgruppen der DWB (S. Seifert, D. Triebel)
- 10.30 Uhr DiversityAgents (DWB-DA): Beschreibung des Moduls – Demo (M. Weiss)
- 10.45 Uhr DWB-DA: Transaktionen an Naturhistorischen Sammlungen am Beispiel von Ausleihen von Material der BSM (C. Novoa Sepúlveda, I. Sebek, M. Weiss)
- 11.00 Uhr DWB-DA: Sammler und Bestimmer an Naturhistorischen Sammlungen, Beispiele aus dem Herbarium M – Demo (BSM collectors) und Beispiele aus dem SMNS (SMNS collectors) (A. Beck, J. Holstein, C. Monje)
- 11.15 Uhr DWB-DA: Tausende Namen in der Flora von Bayern – Wie kuratiere ich mögliche Synonymien, Namensgleichheit und unterschiedliche Schreibweisen (I. Wendt, B. Klasen)
- 11.30 Uhr DWB-DA im Projekt FörTax: Einsatz von DiversityAgents für eine erstmals bundesweite Übersicht der Taxonomischen Bildungsangebote (N. Nöske, Ch. Bräunig)
- 11.45 Uhr Rolle von DWB-DA und Personenangaben in DC und DP bei der Organisation der Datenpublikation in GBIF und NFDI unter Berücksichtigung der DSGVO (T. Weibulat)
- 12.00 Uhr Mittagspause
- 13.00 Uhr DWB-DA, GBIF und Bionomia (D. Triebel)
- 13.15 Uhr DWB Arbeitsumgebung als GFBio Service des NFDI4Biodiversity Konsortiums zum Training und Arbeiten ohne DWB-Installation (S. Bingert, A. Link)
- 13.30 Uhr DWB-DA: Management von Editoren von Exsikkatenwerken und Wikidata (YouTube video, start at 43:56), siehe auch Exsiccata (Wikipedia en) und Wikidata Property Proposal for IndExs Exsiccata Editor ID (Wikidata) (C. Uribe, S. Seifert)
- 13.45 Uhr Diskussionsrunde
- 14.00 Uhr Nachmittagspause
- 15.00 Uhr Diskussionsrunde Software-Entwickler und DWB-Datenbank-Administratoren (C. Garilao, P. Grobe, B. Klasen, A. Link, S. Seifert, T. Weibulat, M. Weiss)
- 17.00 Uhr Ende
| Teilnehmer | Institut | Fachgebiet |
|---|---|---|
| Brigitte Adler | ARGE Flora Nordschwaben e.V. | Botanik |
| Jürgen Adler | ARGE Flora Nordschwaben e.V. | Botanik |
| Melanie Altner | Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie, SNSB | Paläontologie, Sammlungsmanagement |
| Katharina Bohley | Botanischer Garten München, SNSB | Botanik, Sammlungsmanagement |
| Hans-Joachim Esser | Botanische Staatssammlung München, SNSB | Botanik |
| Cristina Garilao | Leibniz Institute for the Analysis of Biodiversity Change, Hamburg | Biodiversitätsinformatik |
| AG Hans-Peter Grossart | Leibniz Institute for Freshwater Ecology and Inland Fisheries, Stechlin | Plankton, Microbial Ecology |
| Felix Hentschel | Mineralogische Staatssammlung München, SNSB | Mineralogie, Sammlungsmanagement |
| Hubert Höfer | Staatliches Museum für Naturkunde, Karlsruhe | Zoologie |
| Renate Matzke-Karasz | Department of Earth and Environmental Sciences, Ludwig-Maximilians-Universität München (Kempf Database Ostracoda) | Zoologie (Ostracoda) |
| Michael Oellermann | PANGAEA, Marum, Bremen | Datenmanagement |
| Karl-Heinz Rexer | Philipps-Universität Marburg, FB Biologie - Evolutionäre Ökologie der Pflanzen | Mykologie |
| Anette Rosenbauer | Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart | Botanik, Präparation |
| Julia Wellsow | Botanische Staatssammlung München, SNSB und SNSB IT Center | Botanik, Flora von Bayern |
Zoom online Event#
- 27 Zoom-Teilnehmer, davon 13 Vortragende und 14 weitere Teilnehmende (s. Liste)
Diversity Workbench Entwickler Plattform#
- DWB Support und training materials
- Diversity Workbench Information Models mit DiversityAgents ER diagram
- Diversity Workbench Software mit DiversityAgents
- DWB User Manual – DiversitAgents (neues Design, prototypisch, Inhalt wird aktuell überarbeitet)
- DWB User Manual(neues Design, prototypisch, Inhalt wird aktuell überarbeitet; diese Darstellungsweise wird die bisherige Präsentation des DWB User Manuals ersetzen)
- DWB Video Tutorials in German
- Empfehlungen für Software-Entwickler
Diversity Workbench – empfohlen von der DFG und GFBio#
- DFG RISources mit Diversity Workbench – Text DE
- GFBio recommended research data management mit DWB in 10 questions
- GFBio guided research data submission mit DWB
Dienste des SNSB IT Centers in seiner Rolle als GFBio Datenzentrum am NFDI4Biodiversity Konsortium, GBIF Data Publisher und CETAF Data Provider#
- Archivierung and Publikation von Bio- und Geodiversitätsforschungsdaten, siehe Portfolios der GFBio Data Centers und Profile des Data Center SNSB
- DWB BioCASe Data pipelines und RDF Dienste mit Übersicht über die Occurrence-Datenbestände publiziert via SNSB
- GBIF Data Publisher SNSB
- Diversity Workbench Support (User help desk) with Training materials and Training environment
Literatur und externe Quellen direkt zum Thema des Workshops#
- Groom Q, Bräuchler C, Cubey RWN, Dillen M, Huybrechts P, Kearney N, Klazenga N, Leachman S, Paul DL, Rogers H, Santos J, Shorthouse DP, Vaughan A, von Mering S, Haston EM. The disambiguation of people names in biological collections. Biodivers Data J. 2022 Oct 10;10:e86089. doi: 10.3897/BDJ.10.e86089. Zum download hier
- Groom Q, Güntsch A, Huybrechts P, Kearney N, Leachman S, Nicolson N, Page RDM, Shorthouse DP, Thessen AE, Haston E (2020) People are essential to linking biodiversity data. Database 2020. https://doi.org/10.1093/database/baaa072. Zum download hier
- Leachman S 2020. Auckland Museum Volunteer Instructions for Bionomia (Version 1). Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.3908727. Zum download hier
- Ozolinčiūtė E, Bülow W, Bjelobaba S, Gaižauskaitė I, Krásničan V, Dlabolová DH, Umbrasaitė J (2022) Guidelines for Research Ethics and Research Integrity in Citizen Science. Research Ideas and Outcomes 8: e97122. https://doi.org/10.3897/rio.8.e97122 Zum download hier
- Shorthouse DP, Page R (2019) Quantifying Institutional Reach Through the Human Network in Natural History Collections. Biodiversity Information Science and Standards 3: e35243. https://doi.org/10.3897/biss.3.35243. Zum download hier
- Shorthouse, David Peter. 2023. Natural history specimens collected and/or identified and deposited. Data set. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.6865507. Zum download hier
- Triebel, D., Uribe-Holguin, C., Seifert, S., Weiss, M., Scholz, P. 2022. Connecting IndExs Editors and exsiccata IDs with Wikidata for Disambiguation of People Names and Work in Botanical and Mycological Collections. Biodiversity Information Science and Standards 6: e93585. – https://doi.org/10.3897/biss.6.93585. Zum download hier
- von Mering S, Kaiser K, Petersen M (2022) Transforming Closed Silos into Shared Resources: Opening up data on historical collection agents affiliated with the Museum für Naturkunde Berlin. Biodiversity Information Science and Standards 6: e93787. https://doi.org/10.3897/biss.6.93787. Zum download hier
- Weiss, M., Hagedorn, G. & Triebel, D. 2023. DiversityAgents information model (version 2.1.23, 3 May 2023). https://www.diversityworkbench.net/Portal/DiversityAgentsModel_2.1.23 (The dwbA Database Scheme as semantic wiki representation is coming later)
- EML Agent Role Vocabulary used in GBIF Portal
- Bionomia und Bionomia Agents
- Wikidata WikiProject: Collectors affiliated with the MfN Berlin
- Richtlinien des SNSB IT Center zum Umgang mit Beobachtungsdaten und Sonderregelungen zur Erstellung einer Flora von Bayern
- Ausführliche und aktuelle Literaturlisten, jeweils mit Fokus auf dem thematischen Schwerpunkt des Workshops, finden sich auf den Websites der online Veranstaltungrn 2020 bis 2023 (siehe Archiv).