Sechsundzwanzigster Diversity Workbench Workshop am IT-Zentrum der SNSB
, veranstaltet in Kooperation mit dem DFG-Verbundprojekt German Federation for Biological Data (GFBio)#
Thema: Allgemeine Einführung in die DWB: Fokus Datenmanangement in Projekten zum Artenmonitoring sowie Management von Trait-Daten
An der Organisation und Durchführung des Workshops beteiligtes Team: D. Triebel, M. Weiss, D. Neubacher, W. Reichert, T. Weibulat, A. Link, V. Sanz und C. J. Monje, SMNS
Organisatorisches #
- Ansprechpartner (Anmeldung, Anreise etc.): I. Sebek, T. Weibulat
- Ort: Botanische Staatssammlung München, Menzinger Str. 67, 1. Stock, Zi 139
- Anreise
- vom Flughafen München (Gesamtdauer ca. 60 min): Von der S-Bahn-Endhaltestelle am Flughafen mit der S-Bahn (S 1) Richtung Hauptbahnhof. Die S-Bahn fährt alle 20 min. Aussteigen an der Haltestelle Moosach. Die Haltestellen zeigt die Übersicht des Schnellbahnnetzes. Ab Bahnhof Moosach mit der Buslinie 51 Richtung Aidenbachstraße. Der Bus fährt alle 10 min. Haltestelle ist Maria-Ward-Straße. Von hier aus sind es 400 m zu Fuß entlang der Menzingerstraße stadtauswärts, wahlweise kann auch noch die Tramlinie 17 (Richtung Amalienburgstraße) für eine Haltestelle benutzt werden. Details zeigt das Innenraumnetz München und die MVV Fahrplanauskunft.
- vom Hauptbahnhof München (Gesamtdauer ca. 20 min): Ab Hauptbahnhof Nord mit der Trambahnlinie 17 Richtung Amalienburgstraße. Die Tram fährt alle 10 min. Haltestelle ist der Botanische Garten München-Nymphenburg. Details zeigt das Innenraumnetz München und die MVV Fahrplanauskunft.
- vom Flughafen München (Gesamtdauer ca. 60 min): Von der S-Bahn-Endhaltestelle am Flughafen mit der S-Bahn (S 1) Richtung Hauptbahnhof. Die S-Bahn fährt alle 20 min. Aussteigen an der Haltestelle Moosach. Die Haltestellen zeigt die Übersicht des Schnellbahnnetzes
- Zeit: 19.10.2015, Beginn: 10.00 Uhr, Ende: ca. 17.30 Uhr
- Mittagspause: ca. 13.00 Uhr bis 13.45 Uhr
- Kaffeepause: ca. 15.00 Uhr bis 15.15 Uhr
- Hardware: eigener Laptop (ab MS Windows XP; .Net Framework 3.5 wird ggf. vor Ort installiert)
Arbeitsprogramm#
Thema ist das Management von verschiedenen Typen von primären Daten v. a. aus Monitoringprojekten, das Management von Merkmalsdaten zu Organismen, Trait-Daten, geographische Daten zu Beobachtungsereignissen und Sammlungsobjekten sowie Vokabularien/ Taxonomien in DWB-Applikationen. Die Teilnehmer werden angeleitet, mit den DWB-Applikationen in Trainingsdatenbanken selbständig zu arbeiten. Neben dem Arbeiten am Laptop/ PC wird auch die Dateneingabe über die Smartphone App "DiversityMobile" demonstriert.
- 10.00 Uhr Diversity Workbench – Einführung
(D. Triebel)
- 10.30 Uhr Einführung in und Arbeiten mit "DiversityCollection", anhand von Beispielen aus Monitoringprojekten; siehe auch DC-Manual (pdf) (M. Weiss)
- 11.45 Uhr DiversityDescriptions: DD 3.0: Management von Artbeschreibungen, ökologischen Parametern, Matrixdaten und Sequenzdaten mit Software-Demonstration; siehe auch DD-Manual (pdf) (D. Triebel, A. Link)
- 13.00 Uhr Mittagspause
- 13.45 Uhr Datenaustausch: Arbeiten mit dem DC-Import-Wizard und einer DWB-Exportschnittstelle mit Beispielen aus Monitoringprojekten (M. Weiss)
- 14.30 Uhr Kurze Vorstellung der Möglichkeiten mobiler Datenerfassung mit der DWB, mit Schwerpunkt auf "DiversityMobile" (T. Weibulat)
- 15.00 Uhr Kaffeepause
- 15.15 Uhr Vorstellung von "DiversityGISeditor", "DiversitySamplingPlots" und "DiversityGazetteers" zur Erzeugung, Management und Verwendung von Geo-Daten (W. Reichert)
- 16.15 Uhr Kurze Vorstellung weiterer DWB-Module, z.B. "DiversityProjects", "DiversityTaxonNames", "DiversityReferences" und "DiversityScientificTerms" (M. Weiss)
- 17.30 Uhr Ende
| Teilnehmer | Institut | Fachgebiet |
|---|---|---|
| Maria Elena Reiner-Drehwald | Georg-August-Universität Göttingen | Bryologie |
| Rafael Matysiuk | Ludwig-Maximilian-Universität München | Datenmanagement |
| Juan Carlos Monje | Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart | Entomologie, Datenmanagement |
| Tanja Schweizer | Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart | Entomologie |
| Annette Rosenbauer | Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart | Botanik |
| Hossein Rajaei | Staatliches Museum für Naturkunde Stuttgart | Entomologie |
| Jörg Spelda | Zoologische Staatssammlung München | Zoologie, Datenmanagement |
| Patrick Dornes | Botanische Staatssammlung München | Lichenologie |
| Petra Führding-Potschkat | IBM München | Datenbanken und Repositorien |
| Andreas Beck | Botanische Staatssammlung München | Lichenologie |
Diversity Workbench Entwickler Plattform#
- Diversity Workbench Information Models
- Diversity Workbench Software
- DiversityMobile App on Windows Phone Store
- Empfehlungen für Software-Entwickler
Zugangsdaten zu den DWB Trainingsdatenbanken#
- IP-Adresse: training.diversityworkbench.de
- Port: 5432
- SQL-Server authentification
- User: WORKSHOP
- Password: available on request
Virtuelle Forschungsumgebungen und DWB Netzwerke, Diversity Mobile#
- DiversityMobile – Smartphone App (WindowsPhone)
Daten in DiversityCollection online#
- via GBIF Portal SNSB GBIF Data Publisher
- via BiNHum (prototype), BioCASE Europe, EDIT Portal, INCT/HV, JSTOR-GPI, VH/de
- 42 BioCase-Wrapper Dienste am SNSB IT-Zentrum
- 10 Webschnittstellen at the SNSB mit Zugriff auf Daten via DiversityCollectionCache
- other interfaces, e.g., via GBOL
Daten in DiversityTaxonNames online#
- via Catalogue of Life/ Annual/Dynamic Checklist Portal: Source databases "GSDs" LIAS und MELnet
- via Webschnittstellen und SOAP/REST Webdienste mit Zugriff auf DTN Datenbanken:
- via Schnittstellen zum Download (in Bearbeitung) und REST Webservice zu Regionalisierten und domän-spezifischen Taxonlisten
- Quellen und Beschreibung unter DTN Taxon Lists Services
- Quellen und Beschreibung unter DTN Taxon Lists Services
Daten in DiversityExsiccatae online#
- via IndExs
Diversity Workbench – DFG recommended#
DFG RISources mit Diversity Workbench – Text DE
Literatur zum Workshop#
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Chapman, A. D. 2005. Principles of Data Quality. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 58 pp. download
Chapman, A. D. 2005. Uses of Primary Species-Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 106 pp. download
Chapman, A. D. & Grafton, O. 2008. Guide to Best Practices for Generalising Sensitive Species Occurence Data. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. – 21 pp. download
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Digitisation Project, version 1.0. Copenhagen: Global Biodiversity Information Facility. –
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